Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ODF2Q5BJF6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms