Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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