Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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