Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SGCAQ16586 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SGCAQ16586 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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SGCAQ16586 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SGCAQ16586 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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SGCAQ16586 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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SGCAQ16586 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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