Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SF1Q15637 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SF1Q15637 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SF1Q15637 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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