Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECTIN1Q15223 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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