Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRAM2Q15035 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAM2Q15035 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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