Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAPQ14761 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAPQ14761 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms