Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL4Q14135 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL4Q14135 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL4Q14135 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL4Q14135 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL4Q14135 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL4Q14135 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL4Q14135 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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