Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAPSNQ13702 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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