Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF5Q13568 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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IRF5Q13568 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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IRF5Q13568 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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