Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms