Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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