Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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