Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms