Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK3Q00526 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms