Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms