Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB25P57735 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB25P57735 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms