Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTCP1P56278 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms