Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms