Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMARCA4P51532 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMARCA4P51532 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms