Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRP9P49458 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRP9P49458 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRP9P49458 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRP9P49458 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRP9P49458 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms