Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCLMP48507 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GCLMP48507 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GCLMP48507 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GCLMP48507 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GCLMP48507 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GCLMP48507 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GCLMP48507 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GCLMP48507 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GCLMP48507 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GCLMP48507 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GCLMP48507 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GCLMP48507 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GCLMP48507 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GCLMP48507 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms