Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP2K4P45985 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP2K4P45985 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP2K4P45985 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP2K4P45985 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP2K4P45985 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP2K4P45985 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms