Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP2P42575 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP2P42575 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms