Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GGCXP38435 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GGCXP38435 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GGCXP38435 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGCXP38435 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms