Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPC1P35052 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPC1P35052 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms