Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC8A1P32418 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms