Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms