Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMA3P25788 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms