Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTSSP25774 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms