Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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