Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4AP20648 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms