Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD53P19397 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD53P19397 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD53P19397 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD53P19397 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD53P19397 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD53P19397 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD53P19397 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD53P19397 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD53P19397 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms