Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB3P16520 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB3P16520 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms