Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAMP11215 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms