Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NGFRP08138 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms