Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms