Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COBLO75128 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COBLO75128 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COBLO75128 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COBLO75128 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COBLO75128 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COBLO75128 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COBLO75128 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COBLO75128 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COBLO75128 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COBLO75128 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms