Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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VEGFDO43915 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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VEGFDO43915 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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VEGFDO43915 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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VEGFDO43915 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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VEGFDO43915 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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VEGFDO43915 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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VEGFDO43915 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VEGFDO43915 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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