Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EDIL3O43854 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDIL3O43854 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms