Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRXO43186 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms