Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms