Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD1AO15047 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms