Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLGNO14967 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLGNO14967 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms