Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APAF1O14727 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APAF1O14727 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APAF1O14727 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APAF1O14727 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APAF1O14727 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APAF1O14727 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APAF1O14727 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APAF1O14727 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APAF1O14727 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APAF1O14727 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APAF1O14727 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APAF1O14727 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms