Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4DGG1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4DGG1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
B4DGG1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms