Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00587B1AMM8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms