Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms