Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms